马耳他是英国教育体制，中、小学免费义务教育。共有学校340所。主要大学是马耳他大学。

马耳他大学是马耳他最好的国立大学，它的悠久历史可追溯到1592年，就建校历史来讲，世界排名第三。大学本部坐落在首都瓦莱塔市中心校园宽敞，环境优美，设施先进，直至2002年底，马耳他大学在校生8500多人，其中包括3500多名外国留学生（有3%的学生在读硕士和博士课程），他们来自包括美国，加拿大，澳大利亚，意大利，法国，德国，英国，中国，日本，利比亚，俄罗斯，阿尔巴尼亚等88个国家。

马耳他大学在未进入欧盟之前就与英国，美国及欧洲各国的大学有着密切的合作关系。马耳他大学的文凭得到所有西方国家的认可。马耳他大学拥有极高的国际声望，在2000年全世界100所威望大学的排行榜中，马耳他大学名列前茅。其先进的教学设备和高超的教学水平可与西方名牌大学持平。该校毕业生被许多世界名校，诸如：哈弗、普林斯顿、爱丁堡、牛津、剑桥等大学录取为研究生和博士生。马耳他大学医学系是马耳他大学主要的部门之一，值得一提的是，马耳他的外科医学技术在整个欧洲甚至是世界上都是非常有名和先进的。大学有十多个院系，提供十几个专业近百个学士、硕士和博士学位课程。国际海事法研究学会和地中海高等教育协会两大国际协会总部就设在马耳他大学。